（一）組建自然資源部。不再保留國土資源部、國家海洋局、國家測繪地理信息局。
（二）組建生態環境部。不再保留環境保護部。
（三）組建農業農村部。不再保留農業部。
（四）組建文化和旅游部。不再保留文化部、國家旅游局。
（五）組建國家衛生健康委員會。不再保留國家衛生和計劃生育委員會。不再設立國務院深化醫藥衛生體制改革領導小組辦公室。
（六）組建退役軍人事務部。
（七）組建應急管理部。不再保留國家安全生產監督管理總局。
（八）重新組建科學技術部。
（九）重新組建司法部。不再保留國務院法制辦公室。
（十）優化水利部職責。不再保留國務院三峽工程建設委員會及其辦公室、國務院南水北調工程建設委員會及其辦公室。
（十一）優化審計署職責。不再設立國有重點大型企業監事會。
（十二）監察部并入新組建的國家監察委員會。不再保留監察部、國家預防腐敗局。
（一）組建國家市場監督管理總局。不再保留國家工商行政管理總局、國家質量監督檢驗檢疫總局、國家食品藥品監督管理總局。
（二）組建國家廣播電視總局。不再保留國家新聞出版廣電總局。
（三）組建中國銀行保險監督管理委員會。不再保留中國銀行業監督管理委員會、中國保險監督管理委員會。
（四）組建國家國際發展合作署。
（五）組建國家醫療保障局。
（六）組建國家糧食和物資儲備局。不再保留國家糧食局。
（七）組建國家移民管理局。
（八）組建國家林業和草原局。不再保留國家林業局。
（九）重新組建國家知識產權局。
（十）調整全國社會保障基金理事會隸屬關系。
（十一）改革國稅地稅征管體制。
